Кожну команду можна подати трьома шляхами: через меню, панель інструментів та з клавіатури. Для переходу до меню вказують мишкою на відповідний його пункт або натискають клавішу Alt, вибирають потрібний пункт клавішами керування курсором, після чого натискають Enter.
Опишемо кожну групу команд меню, подавши її у вигляді таблички, у якій біля кожної команди показана відповідна кнопка панелі інструментів та клавіші для швидкого доступу до команди. Запис Клавіша1+Клавіша2 слід розуміти так: натиснути Клавішу1 і, утримуючи її натиснутою, натиснути Клавішу2.

Група "Файл"

Ця група використовується для роботи з файлами програм.
Для того, щоб прочитати (завантажити) програму з диску, треба вибрати пункт Файл | Прочитати в меню. На екрані появиться вікно системного діалогу, за допомогою якого Ви можете вибрати і прочитати будь-який доступний текстовий файл. Не можна вводити імена файлів, яких немає. Для того, щоб створити новий файл, треба вибрати пункт Файл | Новий в меню.
Аналогічним способом записують (зберігають) файли на диску. Вибравши пункт Файл | Записати як... в меню, Ви отримаєте вікно системного діалогу має такий самий вигляд. Якщо файл вже був записаний і Ви тільки вносили зміни, то система автоматично записує його з тим самим іменем командою Файл | Записати. Коли Ви записуєте новий файл, то обов'язково слід ввести з клавіатури його ім'я у відповідному вікні діалогу. Якщо при цьому Ви вкажете розширення (.pas, .dat, .txt), то файл буде записаний з цим розширенням, інакше система автоматично запише файл з розширенням .pas.
Під час зчитування та запису програм середовище автоматично пропонує підкаталог Algo\Programs\ як стартовий.
За допомогою команди Файл | Записати як... можна записати текст програми у вигляді веб-сторінки зі збереженням структурування та виділення кольорами. Для цього досить вибрати розширення .html.
Зауваження: рекомендується записувати текст програми перед першим виконанням та після набору кожних 20 - 30 рядків, щоб внаслідок випадкових неправильних дій чи перебоїв апаратури не втратити його.

Група "Редагування"

Ця група використовується редагування програм. Способи редагування тексту програми описані в окремому розділі, тут спинимося лише на особливостях цієї групи команд. Зокрема, всі команди групи доступні лише у режимі редагування програми.
Під час роботи з блоками тексту, середовище АЛГО використовує системний буфер обміну, що забезпечує можливість перенесення фрагментів тексту з АЛГО до будь-якої іншої програми та навпаки.
Команда Редагування | Шрифт використовується для встановлення поточного шрифту у вікні редактора. Зі всіх шрифтів можна вибирати лише ті, які мають символи однакової ширини. Якщо вибрати колір символів у вікні вибору шрифту, то цей колір буде стосуватися тієї групи слів, на яку вказує курсор у момент виклику команди.
Зручною є команда Редагування | Впорядкувати, за якою середовище форматує текст програми, тобто записує кожен оператор з нового рядка, робить фіксовані відступи перед вкладеними операторами і т.п. Зауваження: впорядкування проводиться тільки до першої виявленої помилки.

Група "Шаблони"

Шаблони використовують для запису у текст програми операторів, описів та звертань до стандартних функцій і процедур. Відповідні записи поділені на групи, назви яких записані такою ж мовою, як і меню середовища. При вставці оператора у текст програми, наявний текст розсувається.
Текст операторів записується такою ж мовою, як і текст програми. Групи меню Шаблони містять всі наявні в АЛГО описи, оператори та стандартні функції і процедури. Тому цю групу можна використовувати як довіку з наявних у АЛГО конструкцій.
Під час вставки шаблонів звертання до функцій та процедур, список фактичних параметрів містить відповідну кількісь ком, яка вказує на кількість параметрів. Виняток становлять шаблони групи Графіка, які використовують кольори. Сладові R,G,B для кольору в шаблоні не розділяються комами. Для введення чисел, які задають потрібний колір, можна скористуватися комакдою Шаблони | RGB, яка дозволяє за допомогою системного діалогу вибору кольору встановити потрібний колір та записує складові R,G,B цього кольору у текст програми.

Група "Виконання"

Команди групи "Виконання" використовують для керування виконанням програм. Детально про виконання та відлагодження програми описано в окремому розділі.
Зауваження: виконати можна лише повністю завершену програму, яка не містить помилок.

Група "Опції"

Команди групи Опції дозволяють вибирати мову оболонки (меню, підказок, повідомлень середовища) та мову запису програми.
Під час зчитування програми АЛГО автоматично визначає мову, якою написана програма, а мова оболонки - українська. Запис операторів однієї програми різними мовами не допускається. Якщо у програму, написану однією мовою, вставити фрагмент, написаний іншою мовою, то середовище не сприймає ключових слів вставленого фрагменту. Для виходу з цієї ситуації потрібно двічі перемкнути мову програми.
Якщо зчитана програма використовує команди робота, то середовище автоматично вмикає режим з використанням робота. Якщо ж створюється нова програма для робота, то необхідно використати команду Робот | Використовується для активізації вікна робота.

Група "Вікно"

Середовище АЛГО у загальному випадку програма підтримує три вікна: редактор програми, вікно результатів виконання та вікно робота Їх можна по-різному розміщувати на екрані.
За допомогою перших трьох команд групи Вікно можна показати одне з вікон на цілий екран. Команда Каскад розміщує вікна одне на одному з невеликим зміщенням.
Початківцям рекомендується використовувати режим поділу вікна (Вікно | Розділити), щоб усі вікна було видно одночасно.

Група "Довідка"

Клавішею F1 або за допомогою меню можна викликати довідкову систему середовища АЛГО. Якщо у момент натискання клавіші курсор знаходиться на одному з ключових слів мови Паскаль чи назві стандартної функції або процедури, то висвітлюється відповідний розділ довідки. У всіх інших випадках довідкова система починає з висвітлення змісту.
Вибравши пункт "Про програму" можна отримати інформацію про версію середовища АЛГО, а також про автора та видавця програми у вигляді такого вікна